运费增值税税率是9%。一般纳税人适用的税率有：13%、9%、6%、0%。
适用13%税率：销售或进口货物，提供加工、修理修配劳务，提供有形动产租赁服务。
适用9%税率：交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务、销售不动产、转让土地使用权等。
适用6%税率：销售增值电信服务、金融服务、现代服务(租赁服务除外)、生活服务、无形资产(不含土地使用权)
适用0%税率：主要就是纳税人出口货物，境内单位和个人跨境销售国务院规定范围内的服务、无形资产。
法律依据：
《中华人民共和国增值税暂行条例》
第十条
下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：
（一）用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产；
（二）非正常损失的购进货物，以及相关的劳务和交通运输服务；
（三）非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物（不包括固定资产）、劳务和交通运输服务；
（四）国务院规定的其他项目。
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