专利名称：一种组装叶绿体基因组序列的方法专利类型：发明专利发明人：洪棋斌,龚桂芝申请号：CN201410782756.6申请日：20141216公开号：CN104450682A公开日：20150325
摘要：本发明公开了一种组装叶绿体基因组序列的方法，不需要专门分离叶绿体，通过利用新一代测序技术对样品进行测序，根据参考叶绿体基因组序列筛选能mapping到参考基因组的Reads，对筛选获得的Reads进行多个kmer组装，构建Contigs，Contigs序列与参考叶绿体基因组序列比对并排序，选择一个kmer的组装排序结果为主，按照排序结果实现序列的延伸，合并头部和尾部多出部分序列的叠加区域，获得参考组装叶绿体基因组完整序列。本发明方法直接利用NGS基因组测序数据进行DeNovo组装以获得完整叶绿体基因组序列，自身形成了有效的组装和验证的闭环，可以对组装序列的质量进行评价判断。
申请人：西南大学
地址：400712 重庆市北碚区歇马镇柑桔村15号
国籍：CN
代理机构：北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人：汤东凤
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